Protein ZmHAG42 | |
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Information | |
Coreg Name: | ZmHAG42 |
Species: | Maize |
Coreg Family: | GNAT |
Gene Name(Synonym): | HAGTF42 |
Uniprot ID: | K7TLD5 |
Subgenome: | 2 |
ZmHAG42 is a protein in the GNAT family.
Overview of domains present in v5 transcripts | ||||
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PF00583 | PF04055 | PF13673 | PF16199 | |
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Zm00001eb425150_T003 |
Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
---|---|---|---|---|---|
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Zm00001d025713 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
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LEGPYMVKCLA
Secondary Structure Color Code | |
---|---|
BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
STRN | beta strand |
TURN_TY1_P | type I turn |
UNDETERMINED | no data available |
Domains Present | |
---|---|
PF04055 |
|
PF16199 |
|
PF00583 |
|
PF13673 |
|
PF04055 |
|
Hover here to show all domains |
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GCCTCCCGTGTCTGCACGAGCTTGACAATGGCAAAATGGCGAGGACGCGCTCCGGAATACCAGATGAGCGAAGCCACTCGACGGGGATACCACAATCCCAAAAGGCTCGCCAAAACCCCCTCGGCGGTTACCCTTCTCTCCCGATGGCAACCGCCGCCGCCGCCGCCGTGGCGGCACCCGAGCAGCCGCGTCGCCGGAAGCCGGCGCCGGGGCGTGGGGGCGTGGCCCTCCCTGCGGGACTCTCGGAAGAGGAGGCCAGGGTGCGGGCCATCGCCGAGATCGTCTCGGCGATGGGGGAGCTCTCGCGGCGCGGGGAGGATGTGGACCTTAACTCGCTCAAGTCTGCCGCGTGCCGGAGATACGGTCTGGCGCGGGCGCCCAAGCTAGTGGAGATGATCGCCGCCGTGCCCGAGGCCGACCGTGCCACGCTGCTTCCGCGGTTGCGCGCTAAGCCCGTGCGCACGGCGTCGGGTATCGCCGTCGTCGCCGTCATGTCGAAGCCGCACCGTTGCCCACACATCGCCACCACCGGGAACATCTGTGTCTACTGCCCCGGCGGTCCCGATTCCGACTTCGAGTACAGCACGCAATCCTACACGGGATACGAGCCCACCAGCATGCGTGCCATTCGGGCAAGGTATAATCCATATGTGCAAGCCAGGAGCAGGATAGATCAGCTCAAGAGGCTAGGGCATAGCGTGGATAAGGTCGAATTCATCTTGATGGGTGGGACTTTCATGTCCTTACCAGCTGAATATCGTGATTATTTCATCAGAAATCTTCATGATGCTTTATCGGGTCACACTTCTGCAAATGTTGAGGAGGCTATTTGTTATTCGGAACATAGTGCTGTCAAATGTATTGGTATGACGATTGAGACGAGACCTGATTATTGCTTGGGGCCTCATCTGCGCCAGATGCTATCTTATGGTTGTACCCGCTTGGAAATTGGTGTCCAGAGTACATATGAGGATGTTGCCCGTGACACAAACAGAGGACACACAGTGGCTGCTGTTGCTGATTGCTTCTGTTTGGCAAAAGATGCTGGGTTTAAGGTGGTTGCCCACATGATGCCAGATTTACCTAATGTTGGAGTTGAAAGAGATTTGGAAAGTTTCAGAGAATTTTTTGGAAGTCCAGCGTTCCGGGCTGATGGTCTGAAGATTTATCCAACACTTGTGATTCGTGGAACTGGTCTTTATGAGCTCTGGAAAACTGGCAGATATAGAAATTATCCACCTGAGCTGTTGGTGGATATTGTGGCAAGAATTCTGTCTTTGGTACCACCTTGGACACGAGTGTATCGGGTCCAGAGAGATATTCCTATGCCTCTTGTTACTTCTGGTGTCGAGAAAGGTAACCTTCGCGAGCTTGCTTTGGCTCGAATGGAAGATCTGGGCTTAAAATGCCGGGACGTCAGAACCCGTGAGGCAGGGATTCAGGATATCCATCACAAGATCCGGCCAGATGAAGTAGAGCTTGTCAGACGTGACTATGCTGCAAATGAGGGTTGGGAAACATTCCTCTCTTATGAGGATACACGACAGGATATCCTGATCGGGCTGTTGCGCTTGCGTAAATGTGGCCGTAATGTTACATGCCCTGAACTTGTAGGGAGGTGTTCAATTGTGCGTGAGCTTCATGTCTATGGAACTGCAGTCCCTGTGCATGGCCGTGATGTGGACAAACTGCAGCACCAGGGATACGGAACTCTATTAATGGAAGAAGCAGAAAGGATTGCTCGAAAGGAGCACCGATCGAAGAAATTAGCTGTCATTTCGGGGGTTGGTACTCGCCACTACTACCGCAAGTTGGGTTATGAGCTAGAAGGGCCTTACATGGTTAAATGTTTGGCGTAATGCTATTTCATTTTCCGTATCATATAGAGCAGACTAGTGTTTGTAATGTAATATGGGTAGTCTTTTTTAAAAAAAATGATCGTTATACCATTGTTTTCTAATATTGAGTAGTCCAGAACTCCAGATGAAAATGGAGACAACTTTCTATGTATACTGAACGATAGCTAATTTGTCGCTTATCCTCAACTTTGTGCCGTGCAGCAACTGTGATATGTAGTCAGGTTACTCCTTATTTGGTGTTCAAAACCCGTTATCCATGAATGAAGGAAACAATCAATTCAGGTGC
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